A Copel reconhece e valoriza a importância da biodiversidade para a manutenção do equilíbrio ambiental e, sobretudo, da vida. Atualmente, mantém sob seus cuidados áreas protegidas com vegetação nativa que totalizam mais de 24.000 hectares em diferentes biomas, representando importantes refúgios da fauna e da flora nativa regional.

Desse total, mais de 10 mil hectares são de áreas próprias destinadas quase que exclusivamente à conservação do bioma Mata Atlântica, localizadas na Serra do Mar Paranaense e inseridas no maior contínuo conservado desta floresta, que possui uma das mais altas taxas de biodiversidade do planeta. 

Outras áreas protegidas incluem Áreas de Preservação Permanente (APPs) no entorno dos reservatórios das usinas hidrelétricas e áreas destinadas a projetos de compensação florestal, que juntas somam cerca de 10 mil hectares.